El monasterio, que tiene su origen a principios del siglo XV, consta de un convento y de la residencia del emperador. El convento está formado por la iglesia y dos claustros, el primero del siglo XV y el segundo del XVI. La Casa-Palacio tiene dos plantas alrededor de un patio interior. Dentro del conjunto destacan, la iglesia y el claustro antiguo, de planta rectangular, de estilo gótico. El monasterio es la sede de la Fundación Academia Europea de Yuste, constituida el 9 de abril de 1992, que realiza todos los años importantes eventos culturales.
